Page 105 - 《精细化工》2021年第6期
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第 6 期                 刘   春,等:  菌团 HBB 降解竹纤维素纤维及微生物群落功能分析                               ·1167·


            期(0~7 d)BCF CrI(61.98%,为晶体区域在总区                    属。所有样本的覆盖度(Coverage)指数大于 0.99,
            域中的占比)较未处理样品(58.75%)增加。这可                          说明测序深度足够大可以反映样本中微生物的真实
            能是由于部分半纤维素、木质素、以及纤维素非结                             情况。表 1 展示了降解不同时期样本 OTUs 数和多
            晶区域的酶解脱除所致。随后,BCF CrI 急剧下降                         样性指数。可以看出,主要降解期(7 d)的 Chao1
            (22.24%,11 d),这一现象主要是前一阶段脱除易                       指数和 Ace 指数大于初期和后期,说明主要降解期
            降解组分,增大可及度的贡献,也进一步论证了 2.2                          HBB 细菌群落更加丰富。细菌多样性指数是物种丰
            节中关于干物质损失率提升的原因分析。随后,结                             富度和均匀度的综合指标,一般用香浓(Shannon)
            晶 区 域 的破坏 效率 明显下 降, 4 d CrI 降低 了                   指数和辛普森(Simpson)指数表示,Shannon 越大,
            37.86%,这可能与后期样品中结合能较强的氢键类                          Simpson 指数越小,菌落物种越丰富,分布越均匀。
            型和含量有关。                                            主要降解期细菌多样性最高,这在 Simpson 指数中
            2.4   不同时期 HBB 细菌 Alpha 多样性分析                      也得到证实。群落多样性不仅对木质纤维素降解起
                 降解过程 3 个时期(0~7、8~11、12~15 d)共                 着重要作用,对维持生物降解过程的稳定性也发挥
            计 9 份样本共得到有效序列 489429 条,聚类为 239                    着重要作用     [28] 。降解过程中细菌多样性的变化特征
            个 OTUs,隶属于 18 门,26 纲,55 目,85 科,143                 与同期底物降解率增幅正相关。

                                             表 1   样本 OTUs 及 Alpha 多样性指数
                                     Table 1    OTUs numbers and Alpha diversity index of samples
                                                                Alpha 多样性
                样本       有效序列       OTUs 数                                                      Coverage 指数
                                              Chao1 指数     Ace 指数     Shannon 指数   Simpson 指数
              HBB0_1      51888       10         18.5        26.5        0.0056      0.9989        0.99984
              HBB0_2      51437       24         23.0        25.5        0.0462      0.9879        0.99984
              HBB0_3      46881       46         47.0        44.9        0.3938      0.8539        0.99992
              HBB7_1      72245      171        186.5        185.5       3.2009      0.0775        0.99942
              HBB7_2      55777      165        175.8        179.8       3.1276      0.0912        0.99942
              HBB7_3      71635      169        180.3        178.4       3.0823      0.0914        0.99950
              HBB15_1     43550      130        137          139.1       2.5625      0.1521        0.99960
              HBB15_2     51397      140        145.5        146.6       2.5759      0.1579        0.99960
              HBB15_3     44619      134        147.6        148.1       2.6370      0.1363        0.99947

            2.5   属水平 HBB 细菌群落 PCoA 分析和聚类分析
                 降解过程中不同时期样本层级聚类分析如图 5a
            所示。发酵启动时样本 HBB0 自成一簇,主要降解
            期和降解后期样本被聚为一簇,而后被划分为两个
            亚簇;采用 Anosim 分析验证的 PCoA 分析(bray_
            curtis 距离算法)    [29] 进一步研究不同时期细菌群落
            结构的相似性或差异性,结果如图 5b 所示。可以看
            出,HBB0、HBB7 和 HBB15 距离较远,说明不同
            时期样本的群落组成差异较大;采用 Anosim 分析
            的检验结果 R=1.000,P=0.001<0.05,进一步佐证了

            3 组样本组间群落结构差异的显著性。                                 图 5   两典型时期属水平细菌群落 PCoA 分析和聚类分析
                                                               Fig. 5    PCoA analysis and clustering analysis of genus level
                                                                     of bacterial community in two typical periods

                                                               2.6   不同时期 HBB 群落组成和功能差异
                                                                   降解过程 HBB 在门水平上的细菌群落分布如
                                                               图 6a 所示。降解启动时,相对丰度>1%的主要菌落
                                                               构成有厚壁菌门(Firmicutes,占细菌纲平均相对丰
                                                               度 97.26%,下同)、Actinobacteriota(1.39%)、
                                                               Proteobacteria(1.19%)。随着发酵的启动,HBB 群
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