Page 106 - 《精细化工》2021年第6期
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·1168· 精细化工 FINE CHEMICALS 第 38 卷
落结构发生了较为剧烈的变化,主降解期和降解后期 Taibaiella、Brevundimonas、unclassified_o__Bacillales
主要菌落有 Firmicutes、Proteobacteria、Bacteroidota、 (P≤0.001)和 Parapusillimona、Paenibacillus、
Actinobacteriota 和 Verrucomicrobiota,5 个菌门在两 unclassified_c__Bacilli(0.001≤P≤0.01);HBB15
个时期样本中相对丰度分别达到 92.09%和 94.46%, 样本中相对丰度显著高于 HBB7 样本的菌属包括
其中以 Firmicutes 和 Proteobacteria 为主,在两个时 Pseudoxanthomona 、 Cohnella 和 unclassified_o__
期样本中相对丰度分别达到 40.85%、39.83%和 Flavobacteriales,以上菌属两组样本显著性差异 P≤
42.29%、42.45%。 0.001。此外,短芽孢杆菌属是两时期样本中的优势
HBB0 主要起提供菌源的作用,在降解过程中, 菌属,相对丰度显著高于其他菌属,但两组间样本的
随着底物组分、结构和发酵环境的改变,微生物表 显著性差异无统计学意义。两组样本的 Cellulomonas
现出自身的进化策略。因此,本研究关注主要降解 和 Azospirillum 也具有相似的丰度含量。
期(HBB7)和降解后期(HBB15)相对丰度>1%的 BCF 降解过程中的优势菌属 Brevibacillus 在降
属水平微生物群落结构信息,见图 6b。一般认为相 解木质纤维素加速生物质转化的报道较少,但挖掘
对丰度>1%的菌属即为优势菌属。在主要降解期, 其功能的意义重大,其纯系及共培养的产酶特征如
HBB7 样本中相对丰度>1%的菌属有 16 个,分别为 前所述。相比 HBB15 样本,HBB7 样本中相对丰度
短芽孢杆菌属(测序结果为 Bacillus,考虑 HBB0 极其显著高的 Ocrhobactrum、Azorhizobium、Devosia
组实验设计和实际操作,Bacillus 即为本研究中的短 均属于 α-变形菌纲的固氮新种 [31] 。其中,与本研究
芽孢杆菌属,短短芽孢杆菌,因此结果分析时将 相关领域纯系 Devosia 的研究鲜有报道,但在棉秸
Bacillus 和 Brevibacillus 合并,记作 Brevibacillus, 秆自然腐解 [32] 、菌糠堆肥 [33] 等类似研究的群落组成
32.89%,下同)、德沃斯氏菌属(Devosia,16.59%)、 中常有发现。Ochrobactrum 的优势更多体现在与木
苍白杆菌属(Ochrobactrum,7.72%)、Taibaiella 质素有关的方面,同属苍白杆菌属家族的 O.sp,O.
(4.30%)、假黄单孢菌属(Pseudoxanthomona, tritici,O. oryzae 等均能降解木质素或酚类物质 [34-36] ,
4.29%)、纤维单胞菌属(Cellulomonas,4.01%)、 GRANJA-TRAVEZ 等 [37] 研究发现苍白杆菌中的漆
短波单孢菌属( Brevundimonas , 3.97% )、 酶活性,Ochrobactrum 的一些种,如假中间苍白杆
Parapusillimona ( 3.76% )、类 芽 孢杆菌 属 菌(O. pseudintermedium CB2),能够在秸秆发酵
(Paenibacillus,3.13%)、固氮螺菌属(Azospirillum, 过程中利用木质素和半纤维素而不减少纤维素,同
2.15% )、未分 类芽 孢 杆 菌 目 ( unclassified_o__ 时发现该菌表现出好氧环境下良好的酸碱耐受性,
Bacillalales,1.90%)、未分类杆菌纲(unclassified_ 在 pH 为 5.5~9.0的环境下均能较好生长 [38] ;Taibaiella
c__Bacilli,1.54%)、未分类微杆菌科(unclassified_ 多分离于与木质纤维素有关的土壤中,如咖啡种植
f__Microbacteriacea , 1.45% ) 、科恩 氏菌属 园土 [39] 、人参田土壤 [40] 、中国农田 [41] 等。木质素代
(Cohnella,1.39%)、疣微菌属(Chthoniobacter, 谢产物菲、有机氯化合物或芳香化合物等可以为
1.38% )和 未分 类产 碱 杆 菌 科 ( unclassified_f__ Azospirillum 提供碳源 [42-44] ,这种菌属还可以同步产
Alcaligenaceae,1.23%)。在降解后期,HBB15 样本 CMCase 酶和乙酸 [45] 。Cellulomonas 属于放线菌目,
中相对丰度>1%的菌属有 11 个,分别为 Brevibacillus 主要为纤维素酶和半纤维素酶功能菌 [46] 。HBB15 样
(31.26%)、Pseudoxanthomona(30.51%)、Cohnella 本中相对丰度极其高于 HBB7 的优势菌属多与较易
( 7.77% ) 、 未 分 类黄杆 菌目 ( unclassified_o__ 降解的半纤维素和纤维素有关,如 Pseudoxanthomona
Flavobacteriales,6.22%)、Devosia(3.66%)、 有一定的内切纤维素酶、滤纸酶和葡萄糖苷酶活,
Cellulomonas(2.93%)、Azospirillum(2.32%)、 经全基因组测序发现该菌具有木质纤维素降解酶基
Paenibacillus(1.81%)、Parapusillimona(1.69%)、 因,且预测出其利用纤维素生成乙醇的代谢通路 [47] ;
藤黄单孢菌属(Luteimonas,1.46%)和未分类拜叶林 目前,Cohnella 属内已被鉴定出若干种,其中大多
克氏菌科(unclassified_f__Beijerinckiaceae,1.18%)。 数具有纤维素水解或木聚糖水解活性 [48-49] 。可以看
随着降解的进行,主要降解期和降解后期样本 出,主要降解期和降解后期低丰度菌属差异及降解
菌落丰度在属水平上表现出较大的差异。为了进一 速率差异主要与后期底物组分结构特征、发酵环境、
步寻找两个典型时间点样本的差异微生物及其与降 微生物的代谢和活性等因素有关。不同层次碳源的
解存在的可能联系,采用 Student T 检验和双尾检验 利用印证了 HBB 细菌群落间有效的协同作用的论
分析 [30] 统计了前 15 种菌属的物种差异。结果显示: 点。这种协同作用和木质纤维素降解菌系,尤其是
在 95%置信区间,HBB7 样本中相对丰度显著高于 主要降解早期大量木质素降解菌系的存在共同成为
HBB15 样本的菌属包括 Devosia、Ochrobactrum、 BCF 加速降解的重要因素。