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第 1 期 仝建波,等: HEPT 类 HIV-1 逆转录酶衍生物的 CoMFA、CoMSIA 及 HQSAR 分析 ·63·
表 5 不同碎片参数下 HQSAR 的统计结果
Table 5 Statistical parameters for different HQSAR model distinctions
最佳全 最佳全
2
2
模型 碎片区分参数 q r SEE NC 模型 碎片区分参数 q 2 r 2 SEE NC
息长度 息长度
1 A 0.817 0.889 0.60 257 6 22 A/B/C 0.862 0.929 0.53 353 6
2 B 0.752 0.871 0.71 257 6 23 A/B/H 0.840 0.918 0.56 199 6
3 C 0.851 0.925 0.55 151 6 24 A/B/Ch 0.786 0.924 0.66 353 6
4 H 0.668 0.794 0.82 97 6 25 A/B/DA 0.748 0.910 0.72 353 6
5 Ch 0.666 0.794 0.82 97 6 26 A/C/H 0.852 0.937 0.55 199 6
6 DA 0.736 0.875 0.73 307 6 27 A/C/Ch 0.848 0.934 0.56 199 6
7 A/B 0.782 0.893 0.66 257 5 28 A/C/DA 0.761 0.893 0.69 353 5
8 A/C 0.846 0.931 0.56 199 6 29 A/H/Ch 0.844 0.930 0.56 151 6
9 A/H 0.845 0.926 0.56 257 6 30 A/H/DA 0.825 0.916 0.60 307 6
10 A/Ch 0.817 0.898 0.61 307 6 31 A/Ch/DA 0.751 0.879 0.71 199 6
11 A/DA 0.750 0.875 0.71 199 6 32 A/B/C/H 0.854 0.938 0.54 307 6
12 B/C 0.857 0.927 0.54 257 6 33 A/B/C/Ch 0.862 0.930 0.53 353 6
13 B/H 0.752 0.871 0.71 257 6 34 A/B/C/DA 0.757 0.894 0.70 307 6
14 B/Ch 0.752 0.871 0.71 257 6 35 A/B/H/Ch 0.857 0.940 0.54 353 6
15 B/DA 0.770 0.930 0.683 199 6 36 A/B/H/DA 0.797 0.901 0.64 307 5
16 C/H 0.851 0.925 0.55 151 6 37 A/B/Ch/DA 0.719 0.887 0.75 353 5
17 C/Ch 0.851 0.925 0.55 151 6 38 A/B/C/H/Ch 0.849 0.937 0.55 257 6
18 C/DA 0.798 0.885 0.64 97 5 39 A/B/C/H/DA 0.828 0.908 0.59 307 5
19 H/Ch 0.668 0.794 0.82 97 6 40 A/B/C/Ch/DA 0.759 0.886 0.69 257 5
20 H/DA 0.736 0.875 0.73 307 6 41 A/B/H/Ch/DA 0.819 0.911 0.61 353 6
21 Ch/DA 0.736 0.875 0.73 307 6 42 A/B/C/H/Ch/DA 0.824 0.907 0.59 307 5
表 6 不同碎片长度下 HQSAR 的统计结果
Table 6 Statistical parameters for different HQSAR fragment
lengths
碎片区分 碎片 2 2 最佳全息
q r SEE NC
参数 长度 长度
A/B/C/Ch 1~4 0.787 0.868 0.66 151 6
A/B/C/Ch 2~5 0.801 0.875 0.64 151 6
A/B/C/Ch 3~6 0.816 0.908 0.61 353 6
A/B/C/Ch 4~7 0.862 0.930 0.53 356 6
A/B/C/Ch 5~8 0.862 0.938 0.53 353 6
A/B/C/Ch 6~9 0.858 0.937 0.54 353 6 图 4 HQSAR 模型的实际值与预测值散点图
Fig. 4 Polts of observed pEC 50 vs. predicted pEC 50 for
A/B/C/Ch 7~10 0.871 0.932 0.51 199 6
HQSAR model
A/B/C/Ch 8~11 0.850 0.916 0.55 199 5
A/B/C/Ch 9~12 0.876 0.929 0.50 97 5 由图 5a 可以看出,在 R 1 和 R 2 取代基的位置上
A/B/C/Ch 3~4 0.786 0.862 0.66 151 6 有大片绿色区域,说明在此处引入大基团的取代基
A/B/C/Ch 4~5 0.812 0.884 0.62 151 6 有利于活性的提高,例如:化合物 17(R 1 =正丙基,
A/B/C/Ch 5~6 0.852 0.925 0.56 199 6 pEC 50 =5.47)的活性大于化合物 52(R 1 =甲基,
A/B/C/Ch 6~7 0.859 0.932 0.53 353 5 pEC 50 =5.15)的活性,化合物 61(R 1 =异丙基,
A/B/C/Ch 7~8 0.848 0.939 0.56 353 6 pEC 50 =7.99)的活性大于化合物 59(R 1 =乙基,
A/B/C/Ch 8~9 0.857 0.936 0.54 353 6 pEC 50 =7.72)的活性,化合物 47(R 1 =异丙基,
A/B/C/Ch 9~10 0.856 0.927 0.54 199 6 pEC 50 =8.51)的活性大于化合物 45(R 1 =乙基,