Page 147 - 《精细化工》2020年第9期
P. 147
第 9 期 张宪瑞,等: 沃替西汀盐晶体结构及理化性质 ·1861·
2.1.2 VOT-2PA 盐晶体结构分析 (如图 2b 所示)。
VOT-2PA 和 VOT-4PA•H 2 O 的晶体学数据和氢
键分别如表 1 和表 2 所示;两者的晶体结构图如图 表 1 VOT 盐晶体学数据表
Table 1 Crystallography sheet of vortioxetine salts
2 所示(图中灰色代表 C,黄色代表 S,红色代表 O,
晶体学数据 VOT-2PA VOT-4PA•H 2O
绿色代表氢键)。VOT-2PA 盐属于单斜晶系,P 21
化学式 C 18H 23N 2S•C 6H 4NO 2 C 18H 23N 2S•C 6H 4NO 2•H 2O
空间群,轴长为 a=1.2055(3) nm、b=0.7520(2) nm、
分子量 421.55 439.56
c=1.2593(4) nm,轴角为 α=90°、β=98.91(3)°、γ=90°, 晶系 单斜 单斜
3
V=1.1278(5) nm 、Z=2。不对称单元由 1 个 VOT 阳 空间群 P 21 P 21/c
离子和 1 个 2PA 阴离子组成,其中 VOT 阳离子和 2PA 温度/K 293 293
+
+
+
阴离子通过 N1 —H1…O1,N1 —H1…O2 和 N1 — a /nm 1.2055(3) 0.90661(2)
b /nm 0.7520(2) 0.73118(2)
H2…O2 氢键构成三维网格结构(如图 2a 所示)。
c /nm 1.2593(4) 3.50172(10)
2.1.3 VOT-4PA•H 2 O 盐晶体结构分析 α /(°) 90 90
VOT-4PA•H 2 O 盐属于单斜晶系,P 21/c 空间群, β/(°) 98.91(3) 93.346(2)
轴长为 a=0.90661(2) nm、 b=0.73118(2) nm、 c= γ/(°) 90 90
3.50172(10) nm,轴角为 α=90°、β=93.346(2)°、γ=90°, V /nm 3 1.1278(5) 2.31732(10)
Z 2 4
3
V=2.31732(10) nm 、Z=4。不对称单元由 1 个 VOT
3
密度/(g/cm ) 1.241 1.260
阳离子、1 个 4PA 阴离子和 1 个水分子所组成,其 μ /mm ‒1 0.168 1.481
中 4PA 阴离子和水分子通过 O3—H3…O1 和 O3— R 1 0.0474 0.0439
H4…N3 氢键构成 R 4 (18)四聚体合成子,这些四聚 ωR 2 0.1160 0.1095
4
+
+
体和 VOT 阳离子通过 N1 —H1…O1 和 N1 —H2… GOF 1.045 1.073
CCDC 1990452 1990451
O3 氢键构成了 VOT-4PA•H 2 O 盐的一维链状结构
表 2 VOT 盐氢键表
Table 2 Hydrogen bond table of vortioxetine salts
化合物 D—H…A d(D—H)/nm d(H…A)/nm d(D…A)/nm <(DHA)/(°) Symmetry code
+
VOT-2PA N1 —H1…O2 0.088 0.211 0.2915(4) 152 x, y, z–1
+
N1 —H1…O1 0.088 0.229 0.3062(4) 147 x, y, z–1
+
N1 —H2…O2 0.091 0.187 0.2737(4) 159 –x+1, y–1/2, –z+1
+
VOT-4PA•H 2O N1 —H1…O1 0.101 0.166 0.2673(4) 177 x–1, y+1, z
+
N1 —H2…O3 0.087 0.192 0.2786(4) 173 x, y, z
O3—H3…O1 0.086 0.193 0.2783(4) 174 –x+2, –y+1, –z
O3—H4…N3 0.085 0.199 0.2847(4) 171 x, y, z
2.2 Hirshfeld 表面分析 (占 1.5%);对于 VOT-2PA 和 VOT-4PA•H 2 O 来说,
为了在视觉上突出分子间相互作用对晶格排列 H…H 弱作用力的贡献值明显减少(分别占 58.2%和
稳定性的影响,运用 Crystal Explorer 软件生成了盐 60.8%),经典氢键 H…N(分别占 3.2%和 1.7%)和
的 Hirshfeld 和 2D 指纹谱图,如图 3 所示。 H…O(分别占 11.0%和 8.1%)的贡献值明显增加。
图 3 中左边一列是 VOT、VOT-2PA 和 VOT- 经典氢键贡献的增加(对于 VOT-2PA 和 VOT-
4PA•H 2 O 的 Hirshfeld 表面图,白色相当于范德华半 4PA•H 2 O,氢键 H…N 分别增加了 1.7%和 0.2%,H…
径的原子间距,蓝色代表比范德华力较长的距离, O 分别增加了 11.0%和 8.1%)表明氢键在分子间相
红色代表比范德华力较短的距离,Hirshfeld 表面上 互作用中扮演着非常重要的角色。
较大的红点代表经典氢键 H…N 或 H…O 的弱作用 2.3 IR 分析
力。2D 指纹图谱的横坐标为 d i (d i 为表面上的点到 为了深入了解新盐分子间的相互作用 [22] ,对
最近表面原子核的距离,单位为 nm,横轴从左向右 VOT、VOT-2PA 和 VOT-4PA•H 2O 进行了红外光谱表
依次增大),纵坐标为 d e (d e 为表面上的点到最近表 征,结果如图 4 所示。红外光谱是基于化合物的伸缩
面原子核表面的距离,单位为 nm,纵轴从下到上依 振动模式,对原料药的结构、氢键、分子构象和环境
次增大)。由图 3 可见,对于 VOT 来说,大多数弱 极其敏感 [23] 。对于 VOT-2PA 和 VOT-4PA•H 2O 来说,
作用力的贡献是 H…H(占 74.2%)和 H…C(占 质子是从共晶物质羧酸部位的氢转移到 VOT 哌嗪部
19.0%),分子之间的弱作用力 H…N 贡献值非常小 位的氮(N1)上。由图 4 可见,VOT 的 N—H 吸收